Publié le 2025-10-10. Une avancée majeure dans la compréhension de l’évolution des cancers vient d’être annoncée : un nouvel outil, baptisé GoT-Multi, permet désormais de suivre simultanément les mutations génétiques et l’activité des gènes dans des cellules cancéreuses individuelles, même à partir d’échantillons conservés. Développé conjointement par des chercheurs de Weill Cornell Medicine et de l’Université d’Adélaïde, ce dispositif ouvre de nouvelles perspectives pour déchiffrer la progression tumorale vers des formes plus agressives et résistantes aux traitements.
- GoT-Multi améliore considérablement la capacité à analyser plusieurs mutations génétiques et l’activité des gènes sur des cellules cancéreuses individuelles.
- La technologie peut désormais exploiter une plus grande variété d’échantillons pathologiques, y compris ceux conservés chimiquement, ouvrant la voie à l’analyse de vastes collections de données existantes.
- Cette innovation permet de mieux comprendre les mécanismes par lesquels certains cancers deviennent plus agressifs et résistants aux thérapies, comme le passage d’une leucémie indolente à un lymphome agressif.
Fruit d’une collaboration entre les équipes de Weill Cornell Medicine et de l’Université d’Adélaïde, GoT-Multi représente une évolution significative de son prédécesseur, GoT (Génnotypage des Transcriptomes). Si GoT avait déjà marqué une avancée en matière de génomique unicellulaire, il était limité par la détection d’un nombre restreint de mutations et par la nécessité d’utiliser des échantillons frais ou congelés. GoT-Multi surmonte ces obstacles majeurs, offrant une flexibilité accrue pour l’analyse d’échantillons fixés au formol et inclus dans la paraffine, une méthode courante dans les laboratoires de pathologie hospitaliers du monde entier. Cette capacité à exploiter un corpus d’échantillons plus large et plus diversifié est cruciale pour la recherche sur le cancer.
Les chercheurs ont démontré la puissance de GoT-Multi en l’appliquant à l’étude d’une forme de leucémie lymphoïde chronique qui évolue vers un lymphome diffus à grandes cellules B, un phénomène connu sous le nom de transformation de Richter. L’outil a permis de profiler des dizaines de milliers de cellules tumorales individuelles, de suivre plus d’une vingtaine de mutations génétiques et de corréler leur présence avec l’activité cellulaire (prolifération, inflammation) au cours de la progression du cancer. Cette analyse approfondie a révélé des détails inédits sur cette transformation maligne.
« Cette technologie nous confère une puissance nouvelle et substantielle pour répondre à des questions fondamentales sur la manière dont les cancers évoluent, depuis les prémices des excroissances néoplasiques précancéreuses jusqu’à leur transformation en tumeur maligne et, enfin, à la résistance aux traitements. »
Dr Anna S. Nam, professeure adjointe de pathologie et médecine de laboratoire, Weill Cornell Medicine
Le Dr Anna S. Nam, également professeure adjointe de biologie cellulaire et du développement à la Weill Cornell Graduate School of Medical Sciences, est à l’origine du développement de l’outil GoT à la fin des années 2010. Elle est co-auteure principale de cette nouvelle étude publiée le 10 octobre dans la revue Cell Genomics. Le Dr Luciano Martelotto, de l’Université d’Adélaïde, partage la première place d’auteur. Les docteurs Minwoo Pak et Mirca Saurty-Seerunghen, chercheurs postdoctoraux dans le laboratoire du Dr Nam, ont également joué un rôle clé dans ce projet.
Les chercheurs étendent désormais l’utilisation de GoT-Multi à une vaste cohorte de lymphomes résistants au traitement et à l’étude du développement d’autres cancers et états précancéreux. Les nouvelles connaissances acquises grâce à cet outil devraient permettre d’orienter le développement de stratégies thérapeutiques innovantes.
Ce travail a bénéficié du soutien financier du Burroughs Wellcome Fund Career Award for Medical Scientists, du National Institutes of Health Director’s Early Independence Award (numéro de subvention DP5OD029619) et de l’accord de subvention standard du Commonwealth 4-F26M8TZ.