Une avancée majeure dans la lutte contre le Covid-19 pourrait émerger d’Italie grâce à un logiciel novateur capable de prédire l’apparition de nouvelles variantes du SARS-CoV-2. Baptisé ConvMut (pour Mutations convergentes), cet outil unique en son genre promet de révolutionner l’adaptation des vaccins et des traitements, marquant une étape décisive dans la prévention et la prédiction des futures évolutions virales.
Fruit d’une collaboration scientifique entre l’Hôpital Universitaire de Pise (Aoup), le Polytechnique de Milan et l’Institut Spallanzani de Rome, ConvMut repose sur le principe de l’évolution convergente. Le logiciel analyse des millions de séquences virales pour anticiper les mutations les plus probables. Ces mutations sont celles qui permettent au virus de mieux s’adapter à son environnement et de contourner la réponse immunitaire humaine.
Développé par une équipe de chercheurs italiens, dont Daniele Focosi, hématologue et virologue à l’Aoup, Fabrizio Maggi de l’Institut Spallanzani et Anna Bernasconi du Polytechnique de Milan, ConvMut est désormais accessible en ligne. Il est intégré à la plateforme internationale GISAID Data Science Initiative, où il exploite plus de 17 millions de séquences génétiques partagées par des laboratoires du monde entier.
« La pandémie touche aujourd’hui principalement les patients immunodéprimés, mais le virus continue de muter et les vaccins doivent être mis à jour rapidement. ConvMut peut réduire le délai entre l’apparition d’une nouvelle variante et son inclusion dans les vaccins », explique Daniele Focosi. Cette capacité d’anticipation est cruciale pour maintenir l’efficacité des campagnes de vaccination et des traitements.
Selon Fabrizio Maggi, le système permettra de « prédire des mois à l’avance quelle sera la souche dominante, améliorant ainsi l’efficacité des campagnes de vaccination ». De son côté, Anna Bernasconi souligne que ConvMut « automatise l’analyse de l’évolution du virus, fournissant des graphiques et des données en temps quasi réel sur les lignées et les mutations communes ».
Au-delà des vaccins, ConvMut devrait également apporter un soutien précieux à la recherche sur les anticorps monoclonaux. En aidant les sociétés pharmaceutiques à mieux orienter le développement de leurs traitements, le logiciel pourrait contribuer à réduire les échecs lors des essais cliniques.
Avec ConvMut, la recherche italienne démontre une nouvelle fois sa capacité à innover dans la lutte contre les pandémies, en combinant de manière inédite la biologie évolutive et l’intelligence computationnelle pour mieux anticiper et prévenir les menaces sanitaires futures.