Publié le 2025-10-13 17:28:00. Une avancée majeure dans la compréhension de l’évolution des cancers est annoncée : un nouvel outil, baptisé GoT-Multi, permet de suivre simultanément mutations génétiques et activité des gènes au sein de cellules cancéreuses individuelles, ouvrant la voie à de nouvelles perspectives thérapeutiques.
- Le GoT-Multi, développé par Weill Cornell Medicine et l’Université d’Adélaïde, offre une capacité inédite à analyser plusieurs mutations génétiques et l’expression des gènes dans des cellules cancéreuses uniques.
- Cette technologie peut désormais exploiter une gamme plus large d’échantillons pathologiques, y compris ceux fixés au formol et inclus dans la paraffine, une ressource précieuse dans les laboratoires du monde entier.
- Les premières applications de GoT-Multi ont déjà permis d’éclaircir des mécanismes clés de la progression cancéreuse, notamment la transformation d’une leucémie indolente en un lymphome agressif.
Fruit de la collaboration entre les institutions américaines et australiennes, GoT-Multi est une évolution significative de son prédécesseur, GoT (Génotypage des Transcriptomes). Si GoT avait déjà marqué une étape importante dans l’analyse unicellulaire, il présentait des limitations quant au nombre et au type de mutations détectables, et nécessitait des échantillons frais ou congelés. GoT-Multi lève ces contraintes, rendant l’analyse génétique plus accessible et exhaustive à partir d’échantillons archivés.
« Cette technologie nous confère un nouveau pouvoir substantiel pour répondre à des questions importantes sur la façon dont les cancers évoluent, depuis les prémices des excroissances néoplasiques précancéreuses jusqu’à la transformation en tumeur maligne et enfin à la résistance au traitement. »
Dr Anna Nam, professeure adjointe de pathologie et de médecine de laboratoire, Weill Cornell Medicine
Le Dr Anna Nam, chercheuse principale de cette étude et pionnière du développement de l’outil GoT, a souligné l’importance de cette nouvelle capacité, qui permet une analyse dite « multi-omique unicellulaire », c’est-à-dire la récolte de multiples couches d’informations à partir d’une seule cellule. Le Dr Luciano Martelotto, de l’Université d’Adélaïde, a co-dirigé ces travaux aux côtés du Dr Nam, avec le soutien des boursiers postdoctoraux Dr Minwoo Pak et Dr Mirca Saurty-Seerunghen.
Une démonstration probante des capacités de GoT-Multi a été réalisée sur des échantillons de patients atteints de leucémie lymphoïde chronique évoluant vers un lymphome agressif, une transformation connue sous le nom de transformation de Richter. L’outil a permis de profiler des dizaines de milliers de cellules tumorales, d’identifier plus d’une vingtaine de mutations génétiques distinctes et de corréler leur présence avec l’activité cellulaire, révélant ainsi des détails inédits sur cette progression maligne.
Les chercheurs prévoient désormais d’appliquer GoT-Multi à une large cohorte de lymphomes résistants aux traitements, ainsi qu’à l’étude du développement d’autres cancers et états précancéreux. Les informations générées par cet outil promettent d’orienter le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques.
Référence : Pak M, Saurty-Seerunghen MS, Wise K et al. Co-mapping clonal and transcriptional heterogeneity in somatic evolution via GoT-Multi. Génomique cellulaire. 2025 : 101036. DOI : 10.1016/j.xgen.2025.101036