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De nouvelles stratégies antimicrobiennes montrent comment la science s’attaque à la résistance croissante aux médicaments

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Publié le 25 février 2026. Face à la menace croissante de la résistance aux antimicrobiens, des chercheurs explorent un éventail de nouvelles approches thérapeutiques, des médicaments innovants aux technologies de pointe, pour transformer la lutte contre les maladies infectieuses.

  • De nouveaux antibiotiques et combinaisons ont été récemment approuvés, mais la plupart sont des dérivés de classes existantes.
  • Des peptides antimicrobiens, des thérapies basées sur le microbiome et même des bactéries prédatrices sont à l’étude comme alternatives prometteuses.
  • La transplantation de microbiote fécal (TMF) montre des résultats encourageants dans le traitement des infections récurrentes à Clostridioides difficile.

La résistance aux antimicrobiens (RAM) représente un défi majeur de santé publique à l’échelle mondiale. Une étude de 2016 prévoyait qu’environ 10 millions de décès par an pourraient être attribués à cette résistance d’ici 2050. Pour contrer cette menace, des stratégies multidisciplinaires, regroupées sous l’approche « Une seule santé », sont mises en œuvre à différents niveaux – local, national et international – et incluent la surveillance, la gestion des antimicrobiens, la prévention des infections et l’innovation thérapeutique.

Une récente revue publiée dans le British Journal of Biomedical Science résume les différentes pistes thérapeutiques actuellement explorées pour lutter contre la RAM. Ces approches ne se limitent pas aux antibiotiques traditionnels, mais englobent également les vaccins, la thérapie par bactériophage, l’immunothérapie, les thérapies photodynamiques et sonodynamiques antimicrobiennes, les traitements à base d’oxyde nitrique, les nanomatériaux et les technologies de pointe telles que l’intelligence artificielle et les systèmes « organes sur puce ».

Au cours de la dernière décennie, seulement 20 antibiotiques, quatre médicaments antibactériens non traditionnels et sept combinaisons bêta-lactamine/bêta-lactamase ont été mis sur le marché. L’analyse de ces nouveaux antibactériens révèle que la plupart sont des dérivés de classes d’antibiotiques déjà existantes, ce qui les rend potentiellement vulnérables aux mêmes mécanismes de résistance. Parmi les antibiotiques de nouvelle génération récemment approuvés figurent la gépotidacine et la léfamuline.

La léfamuline, une pleuromutiline, bloque la synthèse des protéines en interférant avec la sous-unité ribosomale 50S. Elle a été approuvée par la Food and Drug Administration (FDA) en 2019 pour le traitement de la pneumonie bactérienne communautaire. La gépotidacine, un triazaacénaphtylène, inhibe la réplication de l’ADN bactérien en ciblant les enzymes topoisomérases et a reçu l’approbation en 2025 pour le traitement des infections urinaires non compliquées chez les femmes et les adolescents.

Emblaveo, une association aztréonam/avibactam, a été approuvée en 2025 pour traiter les infections intra-abdominales compliquées, la pneumonie nosocomiale, la pneumonie sous ventilation assistée, les infections compliquées des voies urinaires (y compris la pyélonéphrite) et les infections aérobies à Gram négatif pour lesquelles les options thérapeutiques sont limitées. Ce médicament avait déjà obtenu une autorisation de mise sur le marché de l’Agence européenne des médicaments en 2024. Xacduro, une association sulbactam/durlobactame, a été approuvée pour traiter les infections causées par le complexe Acinetobacter baumannii-calcoaceticus.

Les peptides antimicrobiens (AMP), composants naturels des défenses immunitaires chez les animaux, les plantes et les humains, suscitent un intérêt croissant en raison de leurs propriétés antimicrobiennes et de leur capacité à moduler les réponses immunitaires et à réguler les processus inflammatoires. Plus de 3 000 AMP ont été découverts à ce jour, mais seulement sept, tous issus de bactéries du sol, ont été approuvés pour une utilisation clinique.

La zosurabalpine, un nouveau peptide macrocyclique à spectre étroit, cible Acinetobacter baumannii et devrait entrer en phase 3 des essais cliniques. Il bloque le transport des lipopolysaccharides de la membrane interne vers la membrane externe de A. baumannii et les mécanismes de résistance actuels ne devraient pas l’affecter. Les oligonucléotides antibactériens, des séquences d’acides nucléiques synthétiques, inhibent l’activité bactérienne en se liant à l’ARN par appariement de bases complémentaires.

Les oligomères morpholino phosphorodiamidate conjugués à des peptides (PPMO) ciblent des gènes essentiels et conservés et ont démontré leur capacité à réduire la charge bactérienne dans des modèles animaux d’infections causées par Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, A. baumannii et Klebsiella pneumoniae. Les PPMO bactéricides présentent également une activité antibiofilm, inhibant la formation de biofilms et réduisant la masse des biofilms existants.

Le miel, en particulier le miel de Manuka, est traditionnellement utilisé pour traiter les infections des plaies. Des recherches récentes mettent en évidence ses effets antimicrobiens contre les agents pathogènes résistants aux antibiotiques. Les propriétés antibactériennes du miel sont attribuées à ses caractéristiques physicochimiques (faible teneur en eau, forte osmolarité, pH faible) ainsi qu’à sa composition en peroxyde d’hydrogène, défensine-1, méthylglyoxal et métabolites secondaires.

Le venin d’abeille a démontré des effets antibactériens contre des agents pathogènes multirésistants (MDR), notamment Enterococcus faecalis, E. coli, Staphylococcus aureus et Salmonella typhimurium. Les venins d’araignées contiennent également des toxines AMP précieuses contre S. aureus. Les épices sont également étudiées pour leur activité antimicrobienne, leurs propriétés thérapeutiques et leur capacité à renforcer l’efficacité des antibiotiques conventionnels contre les agents pathogènes résistants.

La thérapie basée sur le microbiome et la transplantation fécale (TMF) représentent une approche innovante. Rebyota, la première biothérapeutique à base de microbiote fécal vivant préparée à partir de selles de donneurs humains et administrée par lavement, a été approuvée en 2022 pour le traitement des infections récurrentes à Clostridioides difficile (CDI). En 2023, la première thérapie orale du microbiote fécal, Vowst, a également été approuvée. Des études confirment l’efficacité de la TMF dans certains contextes cliniques et expérimentaux pour décoloniser et éliminer le portage de bactéries MDR et de gènes de résistance aux antibiotiques.

L’éradication ou la décolonisation des organismes MDR dans l’intestin par la TMF pourrait réduire le risque d’infection et de contamination croisée. Des rapports de cas et des études préliminaires suggèrent que la TMF a permis d’éliminer la colonisation du tractus gastro-intestinal par E. coli et K. pneumoniae chez un patient immunodéprimé, évitant ainsi les effets indésirables, y compris la mortalité, associés à ces organismes MDR chez les patients ayant subi une allogreffe de cellules hématopoïétiques.

Les bactéries prédatrices, considérées comme des « antibiotiques vivants », peuvent tuer et ingérer d’autres bactéries. Elles sont présentes dans les milieux aquatiques et les sols. Bdellovibrio bacteriovorus est une de ces bactéries prédatrices qui peut tuer les bactéries à Gram négatif en moins de 30 minutes sans induire l’autolyse de ses proies, ce qui évite la libération de molécules inflammatoires. Étant donné que la reconnaissance et l’attachement des proies ne dépendent pas d’un seul récepteur et que les enzymes destructrices des proies sont régulées positivement lors de l’invasion, la résistance des Gram négatifs à B. bacteriovorus semble peu probable. Micavibrio aeruginosavorus et B. bacteriovorus ont démontré leur capacité à réduire la prolifération de Serratia marcescens et de P. aeruginosa résistante aux fluoroquinolones dans des modèles d’infection animale, ce qui suggère un potentiel expérimental plutôt qu’une thérapie clinique établie.

L’augmentation de la résistance aux antibiotiques pose des défis mondiaux dans le traitement des maladies infectieuses. De nouvelles stratégies thérapeutiques et antimicrobiens sont étudiées et développées pour réduire la morbidité et la mortalité liées à la RAM, bien que nombre d’entre elles restent expérimentales et ne fassent pas encore partie de la pratique clinique de routine. Un financement continu et une collaboration interdisciplinaire sont essentiels pour poursuivre le développement, l’évaluation et la traduction de ces approches en soins cliniques.

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