Publié le 18 février 2026 01:30:00. Une nouvelle approche informatique développée par des chercheurs américains permettrait d’améliorer la prédiction de la réponse à la chimiothérapie chez les patientes atteintes d’un cancer du sein triple négatif, un type particulièrement agressif de la maladie. Cette avancée pourrait également ouvrir la voie à des traitements plus personnalisés en tenant compte des spécificités ethniques des patientes.
- Un nouvel outil informatique surpasse les méthodes actuelles pour prédire la réponse à la chimiothérapie chez les patientes atteintes d’un cancer du sein triple négatif.
- Un biomarqueur identifié permet d’orienter certains patients vers des thérapies alternatives et révèle des différences significatives entre les tumeurs d’origine asiatique et européenne.
- Les chercheurs ont mis à disposition un guide pour aider les autres scientifiques à utiliser des techniques de déconvolution pour analyser les données génétiques.
Les patientes atteintes d’un cancer du sein triple négatif (CRTN) présentent des réponses variables aux traitements, ce qui rend la prise en charge particulièrement complexe. Pour améliorer la prédiction de l’efficacité de la chimiothérapie, une équipe du MD Anderson Cancer Center de l’Université du Texas a développé une nouvelle approche informatique qui prend en compte les interactions entre les gènes et le microenvironnement tumoral. Jusqu’à présent, les outils existants avaient tendance à négliger ces interactions cruciales.
Cette nouvelle méthode, publiée dans la revue Cell Reports Medicine, repose sur une technique appelée déconvolution, qui permet de décomposer et d’interpréter les différences cellulaires au sein de la tumeur. Selon Wenyi Wang, professeur de bioinformatique et de biologie computationnelle et principal auteur de l’étude,
« Les stratégies de déconvolution ne sont pas universelles. Nous nous efforçons de rendre ces méthodes plus accessibles aux chercheurs sans expérience informatique étendue, dans le but de traduire ces approches analytiques puissantes en outils pratiques que la communauté plus large de la recherche sur le cancer peut facilement appliquer pour faire progresser la médecine de précision. »
Conscients de la diversité des outils disponibles, les chercheurs ont récemment publié un guide détaillé présentant 43 méthodes de déconvolution, afin d’aider les scientifiques à choisir l’approche la plus adaptée à leurs besoins. Cependant, ils ont constaté que les méthodes de classification existantes ne tenaient pas suffisamment compte des changements d’expression des gènes en fonction du microenvironnement tumoral.
Pour pallier ce manque, l’équipe a collaboré avec l’Institut de science des données en oncologie (IDSO) et le Département d’oncologie médicale du sein du MD Anderson pour développer une analyse intégrative qui prend en compte l’expression de l’ARN messager tumoral spécifique (TmS). Ce biomarqueur tient compte du rapport entre les cellules tumorales et les cellules non tumorales, et permet d’identifier les mécanismes spécifiques au cancer. Il prend en compte le fait que les cellules cancéreuses ont un nombre anormal de chromosomes, ce qui affecte l’expression génique.
Les résultats, obtenus à partir d’une étude portant sur 575 patientes atteintes de CRTN d’origines ethniques diverses, ont démontré que le biomarqueur TmS permettait de classer avec précision les patientes en fonction de leur pronostic (favorable ou médiocre). Il s’est avéré plus performant que les méthodes actuelles pour prédire la réponse à la chimiothérapie, ce qui en fait un outil prometteur pour optimiser la sélection des traitements.
De manière significative, le biomarqueur TmS s’est avéré pertinent pour toutes les populations étudiées, tout en révélant des différences importantes dans les microenvironnements tumoraux des patientes d’origine occidentale et asiatique. Ces différences pourraient permettre d’adapter les traitements en fonction de l’origine ethnique de la patiente, afin d’améliorer leur efficacité.
Bien que des études complémentaires soient nécessaires pour valider cet outil et l’intégrer à la pratique clinique, ces premiers résultats suggèrent que le biomarqueur TmS pourrait constituer une avancée majeure dans la prise en charge du cancer du sein triple négatif.
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Cette étude a été financée par le National Cancer Institute, le ministère de la Défense, le Cancer Prevention and Research Institute of Texas (CPRIT), l’American Cancer Society et Lyda Hill Philanthropies. La liste complète des auteurs et leurs éventuelles déclarations d’intérêts est disponible avec l’article.